出生苗栗西山里,後因父親林務局工作遷居新竹縣尖石鄉。小學畢業後,潘朝森考上芎林中學,受教於蕭如松。臺北師範藝術科、臺中師專畢業後,於臺北縣(今新北市)板橋國小擔任美勞教師至退休。客家電視台連續劇《彩色寧靜海》,就是以潘朝森為故事主人翁。
他擅長畫體態柔軟之女性,對於憂鬱靜謐氛圍的捕捉與展現更是一絕,她們的臉孔上有著緊閉的眼與唇和鼻樑,有著符號式的藍調情懷,自畫家1996年之後的作品多是如此。畫風充滿文學味,畫面寧靜,呈現單純中的美感。
「他的畫是『人間性』的探索,他的畫面常有『謎』一樣的人生質疑,充滿挑戰和無奈的感受。」,這是水彩畫家蕭如松為潘朝森的評語。
1972年曾代表我國參加法國坎城國際雙年展的作品〈思〉,榮獲國家榮譽獎後,又在2008年榮獲吳三連藝術獎。